Uniwersytet Ślaski w Katowicach - Centralny System UwierzytelnianiaNie jesteś zalogowany | zaloguj się
katalog przedmiotów - pomoc

Plant functional genomics 01-BI-S3-PLANT
Laboratorium (L) semestr letni 2020/2021

Informacje o zajęciach (wspólne dla wszystkich grup)

Liczba godzin: 26
Limit miejsc: (brak limitu)
Zaliczenie: Zaliczenie z modułu
Literatura: (tylko po angielsku)

1. Grotewold E. 2004. Plant functional genomics: Methods and Protocols. Humana Press, Totowa, New Jersey, pp. 472

2. Allison DB, Page GP, Beasley TM, Edwards JW. 2006. DNA Microarrays and related genomics techniques. Design, analysis and Interpretation of experiments. Chapman and Hall/CRC, Boza Raton, pp. 371

3. Shimkets RA. 2004. Gene expression profiling. Methods and protocols. Humana Press, Totowa, New Jersey, pp. 165

4. Wong ML, Medrano JF. 2005. Real-time PCR for mRNA quantitation. Biotechniques. 39 (1): 75-85.

5. Haas BJ, Zody MC. 2010. Advancing RNA-Seq analysis. Nat Biotechnol. 28(5):421-3

6. McGettigan PA. 2013. Transcriptomics in the RNA-seq era. Curr Opin Chem Biol. 17(1):4-11.

Metody i kryteria oceniania: (tylko po angielsku)

Discussion upon scientific problems coming from practicals and from the literature.

A report from laboratory practical.

Zakres tematów: (tylko po angielsku)

The use of TILLING method for mutation screening in the selected genes (2 practicals)

Gene sequence analysis, in silico translation and evaluation of the effect of identified mutation on protein domain structure (2 practicals)

Gene expression analysis with the use of qPCR (1 practical)

Metody dydaktyczne: (tylko po angielsku)

Laboratory practical carried out according to manuals.

Discussions upon results, evaluating the knowledge on introduced methods of plant genomics, which allow to practice the formulation of scientific hypothesis and conclusions in English language.

Grupy zajęciowe

zobacz na planie zajęć

Grupa Termin(y) Prowadzący Miejsca Akcje
Opisy przedmiotów w USOS i USOSweb są chronione prawem autorskim.
Właścicielem praw autorskich jest Uniwersytet Ślaski w Katowicach.