Mutageneza W2-S1BT19-1BT-31
Laboratorium (L) semestr letni 2022/2023

Literatura obowiązkowa

Maluszynski, M., Szarejko I., Bhatia C.R., Nichterlein K., Lagoda P.J.L. 2009. Methodologies for generating variability. Part 4: Mutation techniques. In: Plant Breeding and Farmer Participation. Ceccarelli S., Guimaraes E.P., Weltzien E. (Eds.). FAO, Rome, pp: 159-194

Maluszynski M., Szarejko I., Małuszynska J. 2003. Mutation techniques. In: Encyclopedia of Applied Plant Sciences. Thomas B., Murphy D.J., Murray B.G. (Eds.) Elsewier Academic Press, pp: 186-201

Maluszynski M., Szarejko I. 2005. Induced mutations in the green and gene revolution. In: In the Wake of the Double Helix: From the Green Revolution to the Gene Revolution. Tuberosa R., Phillips R.L., Gale M. (Eds.). Bologna, Italy, pp: 403-425

Maluszynska J., Plewa M. 2003. Bioassays in Plant Cells for Improvement of Ecosystem and Human Health. A Course Manual. Wydawnictwo Uniwersytetu Śląskiego, Katowice

Kurowska, M., A. Daszkowska-Golec, D. Gruszka, M. Marzec, M. Szurman, I. Szarejko and M. Maluszynski. 2011. TILLING - a shortcut in functional genomics. Journal of Applied Genetics 52(4): 371-90

Literatura uzupełniająca

Brown T.A. 2009. Genomy. PWN, Warszawa

Kurowska, M., A. Labocha-Pawłowska, D. Gnizda, M. Maluszynski and I. Szarejko. 2012. Molecular analysis of point mutations in a barley genome exposed to MNU and gamma rays. Mutation Research - Fundamental and Molecular Mechanisms of Mutagenesis 738-739:52-70

Kurowska, M., M. Małuszynski and I. Szarejko. 2011. Wykorzystanie strategii TILLING w hodowli roślin. Postępy Nauk Rolniczych. 3: 19-32

Manova V., Gruszka D. 2015. DNA damage and repair in plants – from models to crops. Frontiers in Plant Science 6: 885.

Plant Mutation Breeding and Biotechnology. 2012. Shu, Q., B. P. Forster and H. Nakagawa (Eds.) CABI Publishing House, Wallingford, UK

Szarejko, I., M. Szurman-Zubrzycka, M. Nawrot, M. Marzec, D. Gruszka, M. Kurowska, B. Chmielewska, J. Zbieszczyk, J. Jelonek, M. Maluszynski. 2017. Creation of a TILLING population in barley after chemical mutagenesis with sodium azide and MNU. In: Biotechnology for plant mutation breeding. Protocols. Jankowicz-Cieslak J., Tai T.H., Kumlehn J., Till B.J (Eds) Join FAO/IAEA Division, Springer Open, Switzerland, pp. 91-112

Szurman-Zubrzycka M., Zbieszczyk J., Marzec M., Jelonej J., Chmielewska B., Kurowska M., Krok M., Daszkowska-Golec A., Guzy-Wrobelska J., Gruszka D., Gajecka M., Gajewska P. Stolarek M., Tylec P., Sega P., Lip S., Kudelko M., Lorek M., Gorniak-Walas M., Malolepszy A., Podsiadlo N., Szyrajew K., Keisa A., Mbambo Z., Todorovska E., Gak M., Nita Z., Orlowska-Job W., Maluszynski M. and Szarejko I. 2018. HorTILLUS – a rich and renewable source of induced mutations for forward/reverse genetics and pre-breeding programs in barley (Hordeum vulgare L.). Frontiers in Plant Science 9:216

Van Harten A.M. 1998. Mutation Breeding. Theory and Practical Applications. Cambridge University Press, UK

Liczba praktycznych zajęć dydaktycznych (ćwiczeń laboratoryjnych) wynosi 5. Obecność studentów na ćwiczeniach jest obowiązkowa. Dopuszczalna jest tylko jedna nieobecność usprawiedliwiona zwolnieniem lekarskim. Większa liczba nieobecności oznacza brak zaliczenia praktycznej części przedmiotu i niemożność przystąpienia do zaliczenia końcowego. W szczególnych przypadkach decyzja o dopuszczeniu do kolokwium zaliczeniowego podejmowana będzie przez koordynatora przedmiotu po przeanalizowaniu wszystkich okoliczności.

Ćwiczenia rozpoczynają się punktualnie o ustalonej godzinie. Na ćwiczeniach student zobowiązany jest posiadać biały fartuch.

Podstawą zaliczenia całego cyklu ćwiczeń jest obecność na wszystkich zajęciach (dopuszczalna jest jedna usprawiedliwiona nieobecność), wykonanie wszystkich zadań praktycznych, sporządzenie sprawozdań (według wymagań prowadzących ćwiczenia) oraz uzyskanie oceny końcowej co najmniej dostatecznej (3,0) z części laboratoryjnej. Na ocenę z laboratorium składają się: ocena z kolokwiów z ćwiczeń 1 i 2 (40%) , ćw. 3 i 4 (40%) i ćw.5 (20%). Kolokwia będą przeprowadzone w terminach wskazanych przez prowadzących poszczególne ćwiczenia.

Zakres tematów

Ćwiczenie 1. Test aberracji chromosomowych i test mikrojąder. Test wymiany siostrzanych chromatyd – prof. UŚ dr hab. Jolanta Kwaśniewska, Zespół Cytogenetyki i Biologii Molekularnej Roślin

Ćwiczenie 2. Test kometowy - prof. UŚ dr hab. Jolanta Kwaśniewska, Zespół Cytogenetyki i Biologii Molekularnej Roślin

Ćwiczenie 3. Mutageneza chemiczna jęczmienia – dr Marzena Kurowska, Zespół Genetyki i Genomiki Funkcjonalnej Roślin

Ćwiczenie 4. Wykorzystanie strategii TILLING w celu identyfikacji mutacji w genie HvSNAC1 (Stress-responsive NAC1) - dr Marzena Kurowska, Zespół Genetyki i Genomiki Funkcjonalnej Roślin

Ćwiczenie 5. Ocena liczby dwuniciowych pęknięć DNA (Double Strand Breaks, DSBs) poprzez elektroforezę w żelu agarozowym – prof. UŚ dr hab. Damian Gruszka, Zespół Genetyki i Genomiki Funkcjonalnej Roślin

Przeprowadzanie eksperymentów na każdym spotkaniu pod opieką prowadzącego, korzystając z instrukcji do ćwiczeń. Analiza wyników. Sporządzenie raportu, gdy jest wymagany.