Uniwersytet Ślaski w Katowicach - Centralny System Uwierzytelniania
Strona główna

Pracownia dyplomowa IV [W2-S2BI19-2BL-06A] semestr letni 2022/2023
Laboratorium, grupa nr 8

Przejdź do planu zaznaczono terminy wyświetlanej grupy
To jest strona grupy zajęciowej. Jeśli szukasz opisu przedmiotu, zobacz stronę przedmiotu
Przedmiot: Pracownia dyplomowa IV [W2-S2BI19-2BL-06A]
Zajęcia: semestr letni 2022/2023 [2022/2023L] (zakończony)
Laboratorium [L], grupa nr 8 [pozostałe grupy]
Termin i miejsce: Podana informacja o terminie jest orientacyjna. W celu uzyskania pewnej informacji obejrzyj kalendarz roku akademickiego lub skontaktuj się z wykładowcą (nieregularności zdarzają się przede wszystkim w przypadku zajęć odbywających się rzadziej niż co tydzień).
każdy wtorek, 11:30 - 20:30
(sala nieznana)
Terminy najbliższych spotkań: Daty odbywania się zajęć grupy. Prezentują informacje na podstawie zdefiniowanych w USOS terminów oraz spotkań.
Kliknij w datę by zobaczyć tygodniowy plan z zaznaczonym spotkaniem.
Wszystkie zajęcia tej grupy już się odbyły - pokaż terminy wszystkich spotkań.
Data i miejsceProwadzący
Liczba osób w grupie: 1
Limit miejsc: (brak danych)
Zaliczenie: Zaliczenie na ocenę
Prowadzący: Damian Gruszka
Literatura:

Literatura anglojęzyczna (artykuły oryginalne i przeglądowe) na temat biosyntezy steroli oraz brasinosteroidow:

1. Bajguz A, Chmur M and Gruszka D (2020) Comprehensive Overview of the Brassinosteroid Biosynthesis Pathways: Substrates, Products, Inhibitors, and Connections. Front. Plant Sci. 11:1034.

2. Bajguz, A., and Tretyn, A. (2003). The chemical characteristic and distribution of brassinosteroids in plants. Phytochemistry 62, 1027–1046.

3. Choe, S. (2006). Brassinosteroid biosynthesis and inactivation. Physiol. Plant 126, 539–548.

4. Chung, Y., and Choe, S. (2013). The regulation of brassinosteroid biosynthesis in Arabidopsis. Crit. Rev. Plant Sci. 32, 396–410.

5. Fujioka, S., and Yokota, T. (2003). Biosynthesis and metabolism of brassinosteroids. Annu. Rev. Plant Biol. 54, 137–164

6. Joo, S.-H., Jang, M.-S., Kim, M. K., Lee, J.-E., and Kim, S.-K. (2015). Biosynthetic relationship between C₂₈-brassinosteroids and C₂₉-brassinosteroids in rice (Oryza sativa) seedlings. Phytochemistry 111, 84–90

7. Nolan, T. M., Vukašinović, N., Liu, D., Russinova, E., and Yin, Y. (2020).

Brassinosteroids: Multidimensional regulators of plant growth, development,

and stress responses. Plant Cell 32, 295–318

8. Vriet, C., Russinova, E., and Reuzeau, C. (2013). From Squalene to Brassinolide: The Steroid Metabolic and Signaling Pathways across the Plant Kingdom. Mol. Plant 6, 1738–1757.

Zakres tematów:

1. Wykorzystanie metod genetyki do identyfikacji homozygotycznych form mutantów cechujących się zaburzeniami w biosyntezie brasinosteroidów, pochodzących z populacji roślin HorTILLUS

2. Zastosowanie sekwencjonowania DNA do potwierdzania obecności mutacji w badanych genach u wyselekcjonowanych form mutantów

3. Wykorzystanie metod bioinformatyki (programy CodonCode Aligner, Jellyfish, Chimera) do określania wpływu zidentyfikowanych mutacji na sekwencje i konformację kodowanych enzymów zaangażowanych w biosyntezę brasinosteroidów.

Metody dydaktyczne:

Analiza anglojęzycznych źródeł literaturowych, dotyczących badanego zagadnienia, umożliwiająca interpretację uzyskanych wyników w odniesieniu do innych eksperymentów. Wykorzystanie nowoczesnych metod dydaktycznych i tutoringu (m. in. burzy mózgów) podczas interpretacji uzyskanych wyników. Wykorzystanie baz danych sekwencji (m. in. NCBI GenBank, EnsemblPlant) do pozyskiwania sekwencji DNA i białek oraz wykorzystanie narzędzi informatycznych (programy CodonCode Aligner, Jellyfish, Chimera) do określania wpływu zidentyfikowanych mutacji na sekwencje i konformację kodowanych enzymów.

Praca laboratoryjna studenta, z wykorzystaniem w/w metod, pod nadzorem merytorycznym promotora. Analiza i interpretacja uzyskanych wyników przez studenta, pod nadzorem merytorycznym promotora.

Metody i kryteria oceniania:

Ocena ciągła pracy studenta na podstawie postępów w realizacji planu pracy dyplomowej:

- Ocena bardzo dobra: student sumiennie wykonuje polecone zadania, umiejętnie i samodzielnie analizuje i interpretuje uzyskane wyniki, wykazuje się inicjatywą w planowaniu eksperymentów

- ocena dobra: student sumiennie wykonuje polecone zadania, analizuje i interpretuje uzyskane wyniki pod nadzorem promotora,

- ocena dostateczna: student wykonuje polecone zadania, analizuje i interpretuje uzyskane wyniki pod nadzorem promotora,

- ocena niedostateczna: student nie wykazuje zainteresowania realizacją pracy dyplomowej, nie posiada umiejętności analizy i interpretacji wyników eksperymentów.

Uwagi:

GEN

Opisy przedmiotów w USOS i USOSweb są chronione prawem autorskim.
Właścicielem praw autorskich jest Uniwersytet Ślaski w Katowicach.
kontakt deklaracja dostępności USOSweb 7.0.3.0 (2024-03-22)