Bioinformatyka W2-S2BT19-2BT-11
Wykład (W)
semestr zimowy 2021/2022
Informacje o zajęciach (wspólne dla wszystkich grup)
| Liczba godzin: | 15 | ||
| Limit miejsc: | (brak limitu) | ||
| Zaliczenie: | Zaliczenie na ocenę | ||
| Literatura: |
Brown T.A. 2012. Genomy. Wydawnictwo Naukowe PWN, Warszawa. Fletcher H.L., Hickey G.I., Winter P.C. 2011. Genetyka. Krótkie wykłady. Wydawnictwo Naukowe PWN, Warszawa. BIOINFORMATYKA. PODRĘCZNIK DO ANALIZY GENÓW I BIAŁEK. red. A.D. Baxevanis , B.F.F. Ouellette Wydawca: PWN Rok wydania: Warszawa 2004 Bioinformatyka i ewolucja molekularna 2011 Autor: Attword Teresa K., Higgs Paul G. Wydawca: Wydawnictwo Naukowe PWN WPROWADZENIE DO BIOINFORMATYKI Arthur Lesk Wydawca: PWN Rok wydania: 2019 Piśmiennictwo zalecane indywidualnie do tematów referatów proponowanych do samodzielnego opracowania (aktualne publikacje anglojęzyczne z zakresu obejmującego daną jednostkę ćwiczeniową) |
||
| Metody i kryteria oceniania: |
w czasie trwania zajęć prowadzący w sposób ciągły ocenia pracę studenta pod kątem ww. wymagań merytorycznych, weryfikuje jego umiejętności teoretyczne i praktyczne związane z bieżącą tematyką zajęć, ocenia zaangażowanie, solidność i rzetelność podczas pracy i przy sporządzaniu dokumentacji oraz kreatywność w rozwiązywaniu problemów badawczych. Dzięki zastosowaniu metod grywalizacji w procesie dydaktycznym prowadzący aktywizuje studentów i z wykorzystaniem cyfrowych narzędzi, jak np. quizy Kahoot lub Mentimeter, weryfikuje wiedzę na bieżąco w czasie zajęć, co umożliwia ocenę ciągłą studentów w sposób skwantyfikowany. Warunkiem możliwości oceny jest kontakt ze studentem audio-wizualny, w razie braku technicznych możliwości uczestnictwa w zajęciach z wykorzystaniem kamery i mikrofonu obligatoryjna jest responsywność ze strony studenta via chat na kanale MS Teams |
||
| Zakres tematów: |
1. Wprowadzenie i genomiczne bazy danych 2. Algorytmy porównawcze sekwencji 3. Predykcja sekwencji genów i elementów regulatorowych 4. Filogenetyka molekularna 5. Bioinformatyka strukturalna - modelowanie białek 6. Projekt Genom - po co i jak sekwencjonujemy genomy 7. Analizy danych pochodzących z sekwencjonowania wysokoprzepustowego NGS |
||
| Metody dydaktyczne: |
Wykład z wybranych zagadnień z zakresu bioinformatyki z wykorzystaniem prezentacji multimedialnej. Prowadzący w czasie wykładu przekazuje specjalistyczną wiedzę z zakresu bioinformatyki, w stopniu, który umożliwi przeprowadzenie podstawowych analiz z zakresu: wyszukiwania informacji biologicznych w bazach danych, porównywania sekwencji DNA i białek, identyfikacji elementów funkcjonalnych genomu i określania funkcji białek oraz badań filogenetycznych prowadzonych w oparciu o dostępne sekwencje. Ponadto, studenci zapoznają się w metodami analizy danych pochodzących z wysokoprzepustowego sekwencjonowania następnej generacji (NGS). Na każdym wykładzie prowadzący wykorzystuje metody grywalizacji w procesie dydaktycznym przez co prowadzący aktywizuje studentów i z wykorzystaniem cyfrowych narzędzi, jak np. quizy Kahoot lub Mentimeter utrwalając ze studentami wiedzę na bieżąco w czasie zajęć. |
||
Grupy zajęciowe
| Grupa | Termin(y) | Prowadzący |
Miejsca  |
Akcje |
|---|---|---|---|---|
| 1 |
każdy poniedziałek, 9:45 - 11:15,
sala Aula (B-100) |
Agata Daszkowska-Golec, Justyna Guzy-Wróbelska, Agnieszka Janiak, Miriam Szurman-Zubrzycka, Barbara Wójcikowska | 47/ |
szczegóły |
|
Wszystkie zajęcia odbywają się w budynku: Jagiellońska |
||||
Właścicielem praw autorskich jest Uniwersytet Ślaski w Katowicach.